Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms