Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc4O35988 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc4O35988 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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