Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx8O35652 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms