Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Fam240aJ3QNP9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam240aJ3QNP9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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