Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20509G3UZF1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20509G3UZF1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms