Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms