Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc194A0A140LIT1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc194A0A140LIT1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms