Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HCN3Q9P1Z3 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms