Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PHACTR1Q9C0D0 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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