Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CIPCQ9C0C6 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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