Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms