Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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