Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN21Q16825 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN21Q16825 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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