Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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LAMA3Q16787 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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LAMA3Q16787 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LAMA3Q16787 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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