Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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