Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNAPC1Q16533 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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