Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
DDB1Q16531 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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DDB1Q16531 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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