Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SCN9AQ15858 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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SCN9AQ15858 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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SCN9AQ15858 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SCN9AQ15858 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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