Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SS18Q15532 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SS18Q15532 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms