Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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