Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRKQ15262 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRKQ15262 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRKQ15262 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PTPRKQ15262 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PTPRKQ15262 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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