Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC3Q15034 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC3Q15034 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC3Q15034 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC3Q15034 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC3Q15034 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC3Q15034 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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