Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD4Q14839 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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