Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCARF1Q14162 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms