Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
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COL4A6Q14031 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
COL4A6Q14031 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
COL4A6Q14031 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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