Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE6HQ13956 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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