Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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