Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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PKP1Q13835 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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