Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQSTM1Q13501 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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SQSTM1Q13501 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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SQSTM1Q13501 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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SQSTM1Q13501 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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SQSTM1Q13501 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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SQSTM1Q13501 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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