Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKP2Q13309 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms