Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms