Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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