Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECH1Q13011 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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