Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms