Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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