Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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HOXD10P28358 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD10P28358 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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