Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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