Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RNF183Q96D59 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RNF183Q96D59 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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RNF183Q96D59 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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RNF183Q96D59 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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RNF183Q96D59 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF183Q96D59 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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