Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC47Q96A33 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms