Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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CHCHD4Q8N4Q1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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