Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CFAP47Q6ZTR5 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms