Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FAM43BQ6ZT52 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.1 ms