| FIP1L1 | Q6UN15 | LARP7P3-201 | ENST00000579888 | 337 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR3670-1-201 | ENST00000584160 | 65 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR3670-3-201 | ENST00000584855 | 65 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR4424-201 | ENST00000585257 | 86 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC005357.2-201 | ENST00000586473 | 583 nt | TSL 2 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | DISC2.1-201 | ENST00000612827 | 205 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC007405.1-203 | ENST00000623667 | 932 nt | TSL 5 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | SEPT14P19-202 | ENST00000632397 | 370 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | OR2J3-203 | ENST00000641960 | 3342 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | OR5K1-202 | ENST00000642057 | 3466 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | RNU6-1303P-201 | ENST00000364841 | 107 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | SNORA7.4-201 | ENST00000384249 | 137 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR514A2-201 | ENST00000385131 | 88 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | TRAJ21-201 | ENST00000390516 | 55 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | SNORA16.2-201 | ENST00000390991 | 127 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MDM2-210 | ENST00000393413 | 657 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC093382.1-201 | ENST00000413311 | 379 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AL109947.1-201 | ENST00000423747 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC007560.1-201 | ENST00000426912 | 237 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | AL360271.2-201 | ENST00000447710 | 161 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AL109763.1-201 | ENST00000455391 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | AC090607.4-201 | ENST00000558192 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC015813.2-201 | ENST00000578794 | 711 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | MIR6895-201 | ENST00000613497 | 78 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC018692.3-201 | ENST00000623929 | 123 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AP003400.5-201 | ENST00000624827 | 617 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | PSMD5-AS1-215 | ENST00000640622 | 205 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | DYNC2H1-202 | ENST00000375735 | 13678 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | CASC19-280 | ENST00000642102 | 1351 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC004520.1-201 | ENST00000608362 | 1413 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | Y_RNA.231-201 | ENST00000364358 | 102 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | Y_RNA.303-201 | ENST00000364998 | 94 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | Y_RNA.378-201 | ENST00000365652 | 113 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | RNU6-217P-201 | ENST00000384164 | 104 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | SNORD70.1-201 | ENST00000391007 | 85 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | RNU6-876P-201 | ENST00000391295 | 104 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AL356776.1-201 | ENST00000406574 | 447 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | AC022493.1-201 | ENST00000492984 | 337 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | AC009902.1-201 | ENST00000519351 | 183 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC134698.4-201 | ENST00000523451 | 826 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AP002004.1-207 | ENST00000531371 | 526 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| FIP1L1 | Q6UN15 | LINC02305-201 | ENST00000554142 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | LINC02301-203 | ENST00000555798 | 789 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | H3F3AP1-201 | ENST00000559984 | 334 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC011933.3-201 | ENST00000578226 | 372 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC015908.4-201 | ENST00000582334 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC073539.2-201 | ENST00000597113 | 165 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC022017.1-201 | ENST00000608793 | 559 nt | TSL 4 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | uc_338.11-201 | ENST00000619132 | 160 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC090617.10-201 | ENST00000624308 | 134 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AC100810.6-201 | ENST00000638068 | 285 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | HMHB1-202 | ENST00000638299 | 126 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | MTND4P14-201 | ENST00000435799 | 1354 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | THOC2-216 | ENST00000491737 | 4452 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | HSPA4L-202 | ENST00000505726 | 2639 nt | TSL 2 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | ZFYVE16-202 | ENST00000505560 | 6599 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | RNU1-140P-201 | ENST00000365040 | 165 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | TRAJ40-201 | ENST00000390497 | 61 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | RNU6-332P-201 | ENST00000391193 | 108 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | AL139413.1-201 | ENST00000421309 | 217 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | GYPB-201 | ENST00000429670 | 239 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | U91324.1-201 | ENST00000442864 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| FIP1L1 | Q6UN15 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |