Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RNF20Q5VTR2 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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RNF20Q5VTR2 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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RNF20Q5VTR2 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RNF20Q5VTR2 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RNF20Q5VTR2 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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