| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4ATAC17P-201 | ENST00000517272 | 120 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC069113.1-201 | ENST00000517763 | 267 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02301-203 | ENST00000555798 | 789 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL133241.1-201 | ENST00000556832 | 487 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC100810.6-201 | ENST00000638068 | 285 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC096644.4-201 | ENST00000563417 | 2912 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC138915.1-201 | ENST00000565427 | 1685 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ABCG2-204 | ENST00000515655 | 4276 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF676-201 | ENST00000397121 | 2944 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004944.1-201 | ENST00000517807 | 3059 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RGS22-214 | ENST00000523287 | 4033 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DLEU2_6.3-201 | ENST00000340052 | 136 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-100P-201 | ENST00000365255 | 165 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA11.2-201 | ENST00000408318 | 127 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MORN2-203 | ENST00000409131 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092660.1-201 | ENST00000420648 | 371 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC105272.1-201 | ENST00000438604 | 198 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HIGD1AP2-201 | ENST00000446367 | 280 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004936.1-201 | ENST00000451755 | 361 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP14-201 | ENST00000468281 | 468 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL31P58-201 | ENST00000469001 | 379 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC087884.1-201 | ENST00000469738 | 328 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092944.1-205 | ENST00000494885 | 517 nt | TSL 4 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC012055.2-201 | ENST00000504167 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC114781.4-201 | ENST00000513707 | 639 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP356-201 | ENST00000515972 | 94 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD19.2-201 | ENST00000516978 | 73 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL7P20-201 | ENST00000520308 | 745 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYCSP27-201 | ENST00000527643 | 293 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP000763.2-201 | ENST00000540641 | 163 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC011611.2-201 | ENST00000549888 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007151.1-201 | ENST00000572774 | 483 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC131274.4-201 | ENST00000577879 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP001094.1-201 | ENST00000579805 | 193 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02210-208 | ENST00000585118 | 546 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004832.5-201 | ENST00000608677 | 401 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005696.2-201 | ENST00000610120 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL121757.2-201 | ENST00000611223 | 313 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C8orf59-212 | ENST00000615697 | 483 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DLEU2_6.2-201 | ENST00000620994 | 136 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DLX6-AS1_1.1-201 | ENST00000621599 | 180 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCARNA4-202 | ENST00000625402 | 129 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL035425.3-201 | ENST00000564206 | 4996 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC00890-202 | ENST00000569275 | 4595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PRKACB-218 | ENST00000610703 | 4240 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR8K3-203 | ENST00000641662 | 2438 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-37P-201 | ENST00000362692 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.157-201 | ENST00000363638 | 102 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.167-201 | ENST00000363735 | 109 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-11P-201 | ENST00000364234 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-25P-201 | ENST00000383873 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1-201 | ENST00000383898 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-48P-201 | ENST00000384161 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-36P-201 | ENST00000384172 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-4P-201 | ENST00000384205 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-5P-201 | ENST00000384238 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-3P-201 | ENST00000384314 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-16P-201 | ENST00000384385 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-15P-201 | ENST00000384534 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-2-201 | ENST00000384627 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-29P-201 | ENST00000384637 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-9-201 | ENST00000384776 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-33P-201 | ENST00000384793 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL139397.1-201 | ENST00000430456 | 644 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RBMX2P4-201 | ENST00000441256 | 376 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC117503.1-201 | ENST00000472241 | 394 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL633P-201 | ENST00000488974 | 297 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359273.1-202 | ENST00000505585 | 905 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC121154.1-201 | ENST00000507299 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MRPS36P2-201 | ENST00000512569 | 299 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA19.2-201 | ENST00000516013 | 114 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6ATAC13P-201 | ENST00000516152 | 131 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP004607.1-201 | ENST00000524456 | 203 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AF235103.2-201 | ENST00000525753 | 346 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL049775.2-201 | ENST00000557547 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090607.4-201 | ENST00000558192 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005909.1-201 | ENST00000577835 | 755 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4801-201 | ENST00000582704 | 82 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC060780.3-201 | ENST00000589464 | 80 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008121.1-201 | ENST00000603244 | 268 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-6P-201 | ENST00000606623 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ATG5-207 | ENST00000613993 | 733 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC010378.1-201 | ENST00000619270 | 362 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U7.8-201 | ENST00000619968 | 63 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090617.10-201 | ENST00000624308 | 134 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LRIF1-203 | ENST00000494675 | 1912 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PIK3C2G-206 | ENST00000538779 | 4963 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC121333.1-201 | ENST00000567488 | 2709 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TDRD15-201 | ENST00000405799 | 6135 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C5orf46-201 | ENST00000318315 | 506 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-858P-201 | ENST00000362436 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U3.6-201 | ENST00000363622 | 211 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-19P-201 | ENST00000384718 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EIF4E2P1-201 | ENST00000393781 | 255 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FTH1P15-201 | ENST00000406984 | 280 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC245054.2-201 | ENST00000415639 | 319 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL30P16-201 | ENST00000419341 | 429 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |