Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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