Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK5Q16478 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK5Q16478 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms