Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SKIV2LQ15477 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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