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| TTF1 | Q15361 | AC011890.2-201 | ENST00000613393 | 294 nt | BASIC | 3.66 | □□□□□ -1.82 | | |
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| TTF1 | Q15361 | Y_RNA.390-201 | ENST00000383932 | 102 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
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| TTF1 | Q15361 | OPRPN-201 | ENST00000399575 | 1040 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL122016.1-201 | ENST00000403365 | 367 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AC010186.2-204 | ENST00000537668 | 439 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC026765.1-201 | ENST00000547876 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL359237.1-201 | ENST00000554305 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AC009163.5-201 | ENST00000575421 | 637 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC005261.5-201 | ENST00000596280 | 355 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AC093732.2-201 | ENST00000607950 | 274 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL359962.2-201 | ENST00000610044 | 303 nt | TSL 5 BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC159540.2-206 | ENST00000619371 | 355 nt | TSL 3 BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC009248.2-201 | ENST00000619826 | 254 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR3529-201 | ENST00000637713 | 78 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | KBTBD3-207 | ENST00000534815 | 3396 nt | TSL 5 BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | BCHE-201 | ENST00000264381 | 2454 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU6-78P-201 | ENST00000362897 | 107 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | RNU6-942P-201 | ENST00000363002 | 107 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | Y_RNA.279-201 | ENST00000364763 | 95 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| TTF1 | Q15361 | FTH1P15-201 | ENST00000406984 | 280 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |