Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRKQ15262 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRKQ15262 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms